Timin adalah senyawa organik yang terdiri dari cincin heterosiklik yang berasal dari pirimidin, cincin benzena dengan dua atom karbon yang digantikan oleh dua atom nitrogen. Rumus terkondensasi timin adalah C5H6N2O2, menjadi amida siklik dan salah satu basa nitrogen yang membentuk DNA.
Secara khusus, timin adalah basa nitrogen pirimidin, bersama dengan sitosin dan urasil. Perbedaan antara timin dan urasil adalah yang pertama hadir dalam struktur DNA, sedangkan yang terakhir hadir dalam struktur RNA.
Asam deoksiribonukleat (DNA) terdiri dari dua heliks atau pita melingkar. Bagian luar pita terdiri dari rantai gula deoksiribosa, yang molekulnya dihubungkan melalui hubungan fosfodiester antara posisi 3 ‘dan 5’ dari molekul deoksiribosa tetangga.
Salah satu basa nitrogen: adenin, guanin, sitosin dan timin, berikatan dengan posisi 1 ‘dari deoksiribosa. Basa adenin purin dari satu heliks berpasangan atau berikatan dengan pirimidin piridin heliks lainnya melalui dua ikatan hidrogen.
Apa Reaksi timin?
Timin dikombinasikan dengan deoksiribosa (monosakarida, unit paling dasar dari karbohidrat penting secara biologis) menciptakan nukleosida (yang glycosylamines, senyawa biokimia yang terdiri dari nukleobasa terikat dengan ribosa, senyawa organik) deoksitimidin (nukleosida DNA), yang identik dengan istilah ‘timidin’ (senyawa kimia). Fosforilasi: timidin dapat terfosforilasi dengan gugus satu, dua, atau tiga asam fosfat, menciptakan, masing-masing, TMP, TDP, atau TTP (timidin mono-, di-, atau trifosfat). Oksidasi: basa Timin sering teroksidasi menjadi ‘hydantoins’ dari waktu ke waktu setelah kematian organisme. Hydantoin, yang juga dikenal sebagai ‘glycolylurea’, adalah heterosiklik senyawa organik (memiliki atom setidaknya dua unsur yang berbeda sebagai anggota cincin nya).
Apa peran Timin di mutasi DNA?
Sebuah mutasi umum DNA melibatkan dua timin berdekatan atau sitosin, yang, terpapar sinar ultraviolet, dapat membentuk dimer timin (kerusakan struktur molekul biologis seperti DNA terbentuk dari timin melalui reaksi fotokimia), menyebabkan “Kinks” dalam molekul DNA yang menghambat fungsi normal. Mutasi ini bertanggung jawab untuk pembentukan melanoma. Melanoma adalah bentuk kanker kulit yang sering muncul dalam tahi lalat.
Bagaimana struktur mempengaruhi pasangan basa?
Semua empat basa memiliki struktur cincin yang memiliki baik atom karbon dan nitrogen. Akibatnya, mereka sering disebut sebagai “basa nitrogen”. Struktur dasar setiap basa akan dapat memprediksi apa pasangan yang tepat dengannya. Sementara, masing-masing memiliki struktur kimia yang berbeda, mereka dikelompokkan menjadi dua kelompok berdasarkan jumlah cincin mereka. Adenin dan guanin adalah “basa purin” dan memiliki struktur cincin ganda. Sitosin dan timin memiliki struktur cincin tunggal adalah “basa pirimidin”.
Bagaimana Timin menstabilkan struktur asam nukleat?
Dalam DNA, timin (T) berikatan dengan adenin (A) melalui dua ikatan hidrogen, sehingga menstabilkan struktur asam nukleat. Sebuah molekul DNA terdiri dari dua untai nukleotida yang berbentuk spiral sekitar satu sama lain untuk membentuk double keliks. Tulang punggung nukleotida dibuat oleh gula dari satu ikatan nukleotida dengan gugus fosfat dari berikutnya. Dua helai yang disatukan bersama oleh ikatan hidrogen antara basa nukleotida yang berlawanan. Ikatan hidrogen ini sangat spesifik dan hanya terjadi antara pasangan basa komplementer.
Ada dua pembatasan utama tentang bagaimana langkah-langkah silang antara untai DNA dapat dibentuk agar ikatan hidrogen dapat terbentuk dan melingkar teratur double helix terjadi. Awalnya, basa purin hanya berikatan dengan basa pirimidin. Dengan hanya memiliki basa purin yang berikatan dengan basa pirimidin, panjang langkah silang (anak tangga) antara untai DNA akan tetap stabil. Jika basa purin bisa berikatan dengan basa purin atau basa pirimidin dengan basa pirimidin, panjang salib anak tangga akan berubah menyebabkan molekul DNA akan melengkung masuk dan keluar.
Saat kondisi tertentu di samping, hanya ikatan adenin dengan timin dan sitosin hanya berikatan dengan guanin. Ketika ikatan adenin dengan timin, dua ikatan hidrogen terbentuk. Ikatan Tiga hidrogen terbentuk antara sitosin dan guanin. Hanya dua pasangan ini mampu membentuk ikatan hidrogen yang diperlukan untuk menjaga stabilitas molekul DNA. Timin eksklusif antara empat basa karena hanya terjadi pada molekul DNA. Adenin, sitosin dan guanin juga ditemukan pada nukleotida yang membentuk asam ribonukleat, atau RNA. Di dalam sebuah molekul RNA, timin diganti dengan urasil.
